Априорные данные мы, конечно, используем в первую очередь, коррекция не превышает десятка пикселей. Однако же вводить её надо обязательно, ошибка в пиксель-другой уже неприятно бросается в глаза (размер пикселя часто соответствует дифракционном пределу; то есть около 150 нанометров).
Столики с достоточно точным позиционированием, конечно же, существуют, но стоят дороговато (и бывают чувствительны к таким глупостям, как температура), мы обходимся теми, что попроще.